WGI | 遺伝子ネットワーク

◆遺伝子ネットワークの事例：種横断型ネットワークの場合

下図に遺伝子ネットワークの例を示します。
円形や三角形、四角形をノード、ノードを結ぶ線分はノード間の関係性を示し、エッジと呼びます。
この例では、円形のノードは遺伝子、三角形は転写因子であり、四角形は遺伝子が関与する形質や生物学的機能を表します。
ノード内には遺伝子名や生物学的機能情報が記載されますが、本例は模式図のため省略しています。
本例では、2つの生物種のネットワークを示しています。各生物種の遺伝子と転写因子は、それぞれ、青色と赤色のノードで示しています。
遺伝子（円形ノード）間のエッジは、発現プロファイルの類似性（実線）と相反性（点線）、種内ホモログ（二重線）、種間ホモログ（波線）を示します。
転写因子（三角形ノード）が発現を制御する遺伝子（円形ノード）は、矢印のエッジで示されています。
遺伝子（円形ノード）と結合されている遺伝子が関与する形質や生物学的機能（四角形ノード）を参照することで容易・迅速に遺伝子機能情報を取得できます。
種内・種間ホモログは、転写因子や遺伝子機能が保存されている可能性が高いため、ホモログの情報を参照することで、遺伝子探索を加速化できます。
遺伝子の発現プロファイルの類似性・相反性は、関与する生物学的プロセスの同一性を示唆すること、および、遺伝子が発現する時空間の情報も利用できることから、遺伝子探索の有用情報となります。

ウェルグリーン・アイ株式会社

― 膨大かつ多面的な遺伝子・代謝情報を統合したネットワーク解析による遺伝子探索の高速化 ―